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EAU丨免疫基因表达秩序模型预

EAU

年欧洲泌尿外科协会(EAU)大会/年会于年7月8-12日召开。欧洲泌尿外协会是欧洲最大,最具影响力的泌尿外科学术会议,该会议将展示泌尿学领域最新和最相关的科学进展。今天,在尿路上皮癌免疫检验点抑制剂治疗领域,解读分享仁东医学在IMvigor等公共数据集及仁东内部验证数据中的研究成果:免疫基因表达秩序模型预测尿路上皮癌免疫检验点抑制剂治疗的疗效(P),并应邀参与EAU的线上汇报(EAUResourceCentre

EAU21(uroweb.org))。

研究背景

免疫检验点抑制剂(ICB)治疗已被应用于多个癌种,因不加选择地应用ICB治疗有效率较低,故多种组学的研究都在探索ICB治疗的biomarker。目前应用最广泛的biomarker有肿瘤突变负荷(TMB)及PD-L1表达等,但在TMB高的组仍有部分患者ICB治疗无效。IMvigor是阿特朱单抗在转移性尿路上皮癌治疗中有效性、安全性的多中心、单臂、Ⅱ期临床试验。本研究建立了一个基于RNA-seq数据、成对的免疫基因表达秩序模型来预测尿路上皮癌中ICB治疗的疗效。

研究方法

以IMvigor队列中同时有疗效信息及RNA-seq数据的例为基础,纳入46例TCGA免疫治疗同时有RNA-seq数据的队列,补充仁东内部4例膀胱癌免疫治疗且有RNA-seq的患者数据。模型经过:Rank变换、Rank差变换、成对浮动差变换、二元变换后进行特征筛选及建模,最终建立疗效的预测模型。

主要结果

1、模型在IMvigor的验证集中median的AUC达到了0.84,在TCGA验证集中也有0.71。模型的预测效果优于TMB以及GEP。

图1.模型在IMvigor验证集中的效果

2、此外模型预测的高低分组的OS生存也有显著差异,说明模型除了可以预测ICB治疗的疗效也可以提示预后。

图2.模型预测的benefit分组在IMvigor中的Kaplan-MierOS生存曲线

3、PD-L1在肿瘤细胞中表达并与T细胞PD-1结合抑制了T细胞活性,ICB治疗阻断结合解除T细胞被抑制的状态。PD-L1表达高的组IC2+的模型预测的benefit的score显著更高。

图3.PD-L1IC表达分组与模型预测的benefitscore

4、肿瘤的免疫分型为免疫浸润型时,ICB治疗倾向于有效。在免疫分型组中同样也是inflamed型的模型预测benefit的score显著更高。

图4.免疫分型与模型预测的benefitsocre

结论

基于RNA-seq的免疫基因秩序模型可以很好的预测ICB治疗的疗效,同时预测的分组生存也有显著差异。模型的预测可从多个角度解释治疗疗效的原理,未来模型可以继续优化适应多种癌种的免疫治疗预测。

参考文献

1.AuslanderN,etal.Robustpredictionofresponsetoimmunecheckpointblockadetherapyinmetastaticmelanoma.NatMed.Oct;24(10):-.

2.Carter,etal.IMPRESdoesnotreproduciblypredictresponsetoimmunecheckpointblockadetherapyinmetastaticmelanoma.NatMed25,–().

3.ZengD,etal.Macrophagecorrelateswithimmunophenotypeandpredictsanti-PD-L1responseofurothelialcancer.Theranostics.May25;10(15):-

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